在根腐病发生较重的地区，应采用含杀菌剂的种衣剂进行玉米种子包衣处理，或在播种前用杀菌剂拌种。对于镰刀菌和丝核菌引起的根腐病，可以选用75%百菌清可湿性粉剂、50%多菌灵可湿性粉剂、80%代森锰锌可湿性粉剂以种子重量的0.4%拌种，也可以用卫福拌种剂直接拌种。对于腐霉菌根腐病，则应选择杀卵菌药剂，如58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂、64%杀毒矾可湿性粉剂、绿亨1号拌种剂等药剂以种子重量的0.4%拌种。
苗期:1、增施硫酸钾、氯化钾或含钾复合肥，每亩用纯钾6-7公斤作基肥。多划锄，提高地温。加强肥水管理，促苗壮。杜绝病株秸秆还田，减少再侵染源。2、用钾肥灌根防治，病株率在10％以上的，亩用氯化钾3-5公斤，或草木灰50公斤。3、用含杀菌剂的种衣剂进行种子包衣。
玉米根腐病防治，选用抗病品种，倒茬轮作，增施有机肥和磷钾肥，使用包衣种子，发病初期用恶霉灵等农药喷施防治等。
玉米根腐病的防治措施，用种衣剂来拌种子、用轮作来防治。
