水温儘可能與菇棚温度一致，不要用冰涼的水。原基、菇蕾上不要噴水，用噴霧器補水，噴嘴朝上向空間噴霧增濕。補水後，如菇體上有水珠應通風去除。
菌袋補水是重要的增產措施，主要用於栽培週期較長的食用菌。需注意：（1）香菇等轉色完成、出菇前就要補水，補到培養料含水量65%左右。（2）多數食用菌在出完一、兩潮菇後轉潮期進行補水，要先養菌，再補水，補水量控制在原菌袋重量的80%-90%為好。（3）菌絲稀疏、長勢弱、温度低於5℃或料內發生病蟲害時不宜補水。（4）三潮菇後補水時，可同時補充營養物質，常用尿素、糖、磷酸二氫鉀等。
