病原在落叶或发病果实病部越冬。春天病果腐烂，病部的小黑点，即病原的子座、子囊壳或分生孢子器，产生子囊孢子或分生孢子进行初侵染或再侵染。
苹果黑腥病病原越冬：病原在落叶或发病果实病部越冬。春天病果腐烂，病部的小黑点，即病原的子座、子囊壳或分生孢子器，产生子囊孢子或分生孢子进行初侵染或再侵染。
病原主要以菌丝体在病枝和芽鳞内或以子囊壳在病叶中越冬。第2年春天，子囊孢子成熟，降雨后从子囊壳中弹射出来，随风雨传播，成为当年的初侵染源。病原侵染后在病斑表面产生分生孢子，成为再次侵染的主要来源。病原可被蚜虫传播。
苹果黑星病菌以菌丝体在枝溃疡和芽鳞内或子囊壳在落叶上越冬。子囊孢子到第二年春季成熟，田间分生孢子在6～7月份最多。病菌也可被蚜虫传播。寄主最易受害时期为花蕾开放与花瓣脱落期间，萼片上的病斑为以后侵染果实的最好菌源。因此，早春为病害发生的重要时期。在苹果感病期间，天气连绵多雨，适于病菌初次侵染。果实成熟期间被害，导致贮藏期间及运输中的损失。苹果各品种间抗病性存在差异，小苹果品种中，黄太平最感病，其次为黄海棠和花红，河南海棠、三叶海棠较为抗病；多花海棠是高抗品种。大苹果品种，国光和富士较易感病；其次为印度、红星、金冠、祝光、旭、黄魁等品种抗病力强。
