菌核薄片状或豆瓣状，大小3～18毫米，黑色，表皮光滑，切片外层细胞黑色，内层具无色菌丝交织，萌发时菌核上长出子囊盘1～14个，多为4～5个，盘柄棕黄色，平滑；子囊盘浅红褐色，直径0.4～8毫米，子囊和侧丝整齐地排列在子囊盘上。子囊圆柱形，基部细狭，大小170～242×7～16微米，内含长椭圆形的子囊孢子8个，子囊孢子具隔，无色，两端钝圆，大小12～20×7～10微米。以菌核在土壤中或蒜种上越冬传播。菌核病发生主要与4-5月气候有关，该期多雨、寡光照，气温在20-25℃时，发病严重。
