西瓜苗期用保护性杀菌剂代森锰锌喷施，防止感染病菌。可以用多菌灵，白菌清等杀菌类药剂。西瓜苗期多发立枯病猝倒病，苗床用五氯硝基苯消毒，用农用链霉素喷雾。主要有百菌清、多菌灵、甲基托布津、苏克灵、杀毒矾、普里克等常用药。药剂防治应遵循预防为主，在未发病时定期喷药预防，效果显著。最好选择高效低毒、残留少的农药。
