獸用恩諾沙星與安普黴素、氨苄西林、頭孢菌素類（頭孢氨苄、頭孢拉定）、氨基糖苷類（鏈黴素、新黴素、慶大黴素、卡那黴素）、磺胺類、多肽類等藥物配伍使用時，療效增強。
一、獸藥恩諾沙星最佳配伍
1、恩諾沙星和安普黴素配伍使用效果較好，因為安普黴素主要是通過阻礙細菌蛋白質的生物合成，從而達到抑制和殺滅細菌的目的，而恩諾沙星主要通過特異地作用於細菌DNA迴旋酶，抑制其活性，影響DNA的解鏈和封鏈過程。兩種藥物配伍使用，可對細菌複製和翻譯過程產生雙重阻斷作用，從而增強藥效。
2、除開安普黴素以外，恩諾沙星與頭孢氨苄、頭孢拉定、氨苄西林、鏈黴素、新黴素、慶大黴素、卡那黴素、磺胺類、多肽類等藥物配伍使用時，能夠增強療效。
二、獸藥恩諾沙星配伍禁忌
1、獸用恩諾沙星不宜與四環素類（強力黴素、金黴素、土黴素、四環素）、氟苯尼考、呋喃類、羅紅黴素等藥物混合使用，否則會導致藥物療效減低。
2、獸用恩諾沙星不宜與氨茶鹼混合使用，因為恩諾沙星會抑制氨茶鹼的代謝，導致血藥濃度中，氨茶鹼的濃度增高，從而引起中毒。
3、獸用恩諾沙星不宜與金屬陽離子混合使用，否則會形成不溶絡合物。
4、恩諾沙星不宜與抗膽鹼藥(阿托品、654-2)、H2受體拮抗劑(西咪替丁、法莫替丁)等藥物配伍使用，否則會導致恩諾沙星的生物利用度下降。
5、恩諾沙星有抑制肝藥酶的作用，與在肝臟中代謝的藥物（如紅黴素、林可黴素）配伍合用，可使其清除率降低，從而導致血藥濃度升高。
