塑膜棚架育苗、營養塊育苗、地膜平鋪育苗、雙膜育苗、通氣網膜育苗是五種常見通用的棉花種子育苗技術。育苗前有一系列準備工作：晒種、浸種和拌種。晒種有利於打破棉種的休眠狀態，促進種子發芽，提高種子發芽率；浸種主要促進種子萌發；拌種有利於提高出苗率，預防苗期病害。
一、晒種
一般在播種前15天進行晒種，可以打破棉種的休眠狀態，有效殺死棉種表皮病菌，減輕苗期病害，促進種子後熟，增強種子吸水力和種皮透氣性，提高種子發芽率和發芽勢，促進種子發芽。毛籽種子在強光天氣條件下晒3~5天，每天晒5~6小時，一般晒黑厚度在10釐米以下，每天翻3~4次，保證晒黑均勻。脫絨包衣種子必須在弱光天氣條件下晾乾1天左右。晒種子時，請特別注意不要在石板、水泥地板或塑料薄膜上晒種子，以免在高溫下燒傷棉種子，影響種子的發芽率。
二、浸種
溫湯浸種是中國一直沿用至今的傳統的毛籽處理方法，其主要作用是促進種子萌發出苗，尤其是在土壤墒情較差的條件下，有助於實現一播全苗，脫絨包衣種子不能浸種。溫湯浸種一般沒有減輕苗期病害的作用，相反浸種時間過長，種子內養分流出過多，可能會加重苗期病害的發生。因此，浸種的關鍵是把握種子的吸水不要太多。一般來說，達到種子本身風乾重量的60~70%、種皮發軟、子葉分層為宜。浸泡時間的長短取決於水溫，在18~20℃的條件下浸泡12~16小時，撈出控幹進行藥劑拌種，不需要強調溫湯浸種，不提倡催芽。
三、拌種
藥物拌種可以殺死種子攜帶的病菌和播種後周圍土壤中的病菌，提高出苗率，防治苗期病害，配合使用殺蟲劑拌種，也可以減輕苗期蟲害的危害。拌種藥劑包括一定數量的殺菌劑、殺蟲劑，以及適量的植物生長調節劑等。常用的藥劑和處理方法是按20斤幹棉種用50%多菌靈可溼性粉劑50克加50%福美雙可溼性粉劑30克加新高脂膜混合，或者用40%混合雙可溼性粉劑125克加新高脂膜混合。
四、育苗
1、塑膜棚架育苗：全國各生態棉區多采用塑膜棚架育苗的方式，主要在播種、覆蓋土壤後，用弓架覆膜，將周圍密封，齊苗後通風降溫。
2、營養塊育苗：營養塊育苗又稱方格育苗、方塊育苗，各地採取的措施名稱不同，如用河泥、塘泥等作為床土進行方格育苗的稱為河泥方格育苗。
3、地膜平鋪育苗：地膜平鋪育苗省工節本、管理程式簡化、操作技術簡便，容易被大眾掌握，直接將地膜鋪在床上，在棉芽頂土時破膜放苗，使用的地膜厚度只有常用農膜厚度的18%。苗期陰雨天氣多的地區用此法育苗病苗、死苗比較嚴重，生產上要適當推遲育苗期，可在晚茬移栽棉田中應用。
4、雙膜育苗：雙膜育苗在播種覆土後，鋪上一層地膜，再加蓋拱棚的育苗方式，解決了早春播種後陰雨低溫天氣易造成僵苗、病苗的問題，育出的棉苗質好、現蕾期提早。
5、通氣網膜育苗：通氣網膜育苗將通氣網膜沿中線剪開，中間縫合寬10~15釐米的尼龍窗紗，覆蓋在棚架子上，溫度、溼度通過通氣網開放的部分自然調節，不需要日夜覆蓋。
