1、草木灰是鹼性肥料，不宜與硫酸銨和硝酸銨混存、混用。硫酸銨、硝酸銨和碳酸氫銨都是銨態氮肥，若將它們和草木灰混在一起，就會使氮肥裡面的氮變成氨氣跑掉。草木灰在與酸性肥料同時使用時，一定要注意不可將它們混在一起。
2、草木灰不宜與人糞尿、家畜糞尿混存。農村習慣將草木灰倒入茅坑或豬圈內貯存，這種做法是錯誤的。家畜糞尿、人糞尿等是一種遲效酸性氮肥，如將含鹼性的草木灰倒進含酸性的家畜糞尿、人糞尿上，酸鹼中和使氨揮發，從而降低肥效。草木灰與家畜糞尿混存1周，就可使糞尿中的銨態氮素損失一半以上，混存時間越長，氮素損失越多。
3、草木灰中的養分易溶於水，為儲存灰分，應單獨貯存在灰庫或灰棚等遮風避雨的地方，以防風吹雨淋。雨淋後的灰分，鉀素會受到嚴重的損失。
4、草木灰也不能與過磷酸鈣混存和混用，混後會降低磷的有效性。
