1、液態菌劑的使用方法：可用於拌種、浸種、蘸根、噴根、噴施、灌根，其中浸種可提高種子發芽率，並增強抗病能力；蘸根可促進早髮根、多生根，根系發達。2、固態菌劑的使用方法：可用於拌種、浸種、拌土，其中浸種可將固態菌劑浸泡1-2小時後，用浸出液浸種；拌肥可將固態菌劑與農家有機肥混合，作基肥或追肥使用。3、生物有機肥的施用：作基肥時，可在整地前撤施到地裡，然後耕翻；作追肥時，可靠近苗根灑入生物有機肥。
一、微生物肥料的使用方法
1、液態菌劑的使用方法
（1）拌種：播種前將種子浸入10-20倍菌劑稀釋液或用稀釋液噴溼，使種子與液態生物菌劑充分接觸後，再放置在陰涼地進行陰乾播種。
（2）浸種：菌劑加適量水浸泡種子，撈出晾乾，待種子露白後播種，可提高種子發芽率，並增強抗病能力。
（3）蘸根：將液態菌劑稀釋10-20倍，然後在幼苗移栽前將其根部浸入液體沾溼後取出，再栽入穴內，並覆土，可促進早髮根、多生根，根系發達。
（4）噴根：幼苗較多時，可用10-20倍稀釋液放入噴筒中噴溼根部即可。
（5）噴施：液態微生物菌劑含有固氮菌、光合細菌等微生物，可用作葉面噴施，將液態菌劑按要求的倍數稀釋，然後選擇陰天無雨的天氣，或陽光不太強的早晨或者傍晚噴施在葉子的正面和背面。
（6）灌根：按1：40-100的比例攪勻後，按種植行灌根或灌溉果樹根部周圍。
2、固態菌劑的使用方法
（1）拌種：播種前用清水或小米湯噴溼種子，拌入固態菌劑充分混勻，待所有種子外覆有一層固態生物肥料時便可播種。
（2）浸種：將固態菌劑浸泡1-2小時後，用浸出液浸種。
（3）拌肥：固態菌劑可與農家有機肥混合，作基肥或追肥使用，每1000克固態菌劑與40-60公斤充分腐熟的有機肥混合均勻後使用。
（4）拌土：在作物育苗時，摻入營養土中充分混勻製作營養缽；也可在果樹等苗木移栽前，混入稀泥漿中蘸根。
3、生物有機肥的施用
（1）基肥：在整地前撤施到地裡，然後耕翻。大田作物每畝施用40-120公斤，經濟作物與設施栽培作物根據當地種植習慣可酌情增加用量。
（2）追肥：在苗旁開溝，靠近苗根灑入生物有機肥，然後覆土。相比化肥，生物有機肥作追肥時要提前7-10天，用量按化肥作追肥的等值投入。
二、微生物肥料有哪些
按照目前微生物肥料製品的功能，微生物肥料主要分為兩大類，分別是狹義的微生物肥料和廣義的微生物肥料。
1、狹義的微生物肥料：通過其中所含微生物的生命活動，增加了植物營養元素的供應，包括土壤和生產環境中植物營養元素的供應總量，從而改善植物營養狀況，進而使產量增加。代表品種為各種根瘤菌肥料，主要應用於豆科植物。
2、廣義的微生物肥料：通過其中所含微生物的生命活動導致作物增產，它不僅僅提高了植物營養元素的供應水平，還能產生植物生長激素刺激植物的生長，拮抗某些病原微生物而產生的抑制病害的作用，減少農作物病蟲害，幫助植物對營養元素的吸收利用。
