畸形菇的表現形式是多種多樣的，生產上常見的主要有：“地雷菇”、“空心菇”、“大屁股菇”、“早熟菇”。
“地雷菇”形成的原因主要是覆土材料過粗，土質偏硬，覆土較厚，覆土層表層含水較少，而其下部及基料的溫溼條件又適合子實體發生和生長，故易在料表或覆土層中下層分化形成子實體，然後鑽出土面。解決辦法：選取優質腐殖土，最好使用草炭土，即使在一般耕地取土且挖取20釐米以下的生土也不要緊，可按比例摻入一定量的腐熟牛糞或麥糠、稻殼等；在取土、晒土及處理過程中，應予過篩，使土粒大多保持與小麥粒大小，最大的可有玉米粒的1/2左右，並伴有部分土粉；覆土不必過厚，一般3釐米左右即可，有條件的可先覆一層厚1—1.5釐米的粗土，後覆細土，並注意使其保持均勻相應的含水率。
“空心菇”形成的原因是由於覆土層含水不足，或基料含水偏低，使菇體正常生長對水分的需求得不到滿足，是發生空心菇的主要原因。除解決覆土層含水問題外，適當的棚溼是有效的輔助手段，一般可調控在85—90%的範圍內，過高過低均不利。
“大屁股菇”形成的原因是棚溫驟升驟降，溫差幅度大，或受冷、熱空氣襲擊，菌蓋菌柄生長不平衡；或因棚溼過低，而覆土層含水適宜等原因，均可發生大屁股菇。此外，某些化學藥物也可導致該種畸形菇的發生。
“早熟菇”的發生原因主要有菇蕾過密、營養不良，使幼菇過早老化開傘；棚溫偏高使幼菇早熟；溼度偏低亦可引起菇體早熟。
此外，某些藥物、油類物質及氣體如農村常用的柴油、食用菌上常用的敵敵畏、加溫火爐產生的一氧化碳、二氧化碳等，還可導致其他若干種畸形菇發生，應根據具體情況，認真分析原因，對症下藥，以免生產受損。
