藥劑防治：可選用10％世高水分散粒劑1500倍液或50％利黴康可溼性粉劑600倍液或40％福星4000～6000倍液均勻噴霧防治。注意交替用藥。微生物菌劑防治：用微生物菌劑200-500倍液噴霧，連噴3回，每次間隔5天。注意噴施微生物菌劑與化學藥劑需要間隔1天。
葉片染病，葉面出現橢圓形或不規則形淡黃色病斑，葉背面病斑上長出灰褐色至黑褐色的絨狀黴層，是病菌的分生孢子梗和分生孢子。條件適宜時，病葉正面也長出黴層。病害嚴重時可引起全葉捲曲，植株呈現黃褐色乾枯。果實染病，果蒂附近形成圓形黑色病斑，硬化稍凹陷，不能食用。嫩莖及果柄上的症狀與葉上相似。
番茄葉黴病施藥避開高溫時間段，最佳施藥溫度為20℃—30℃。或在發病前或發病初期用3億CFU/克哈茨木黴菌葉部型300倍液稀釋噴霧，每7天噴藥1次，發病嚴重時，3-5天用藥1次。重要防治時期：開花期和果實膨大期。
防治措施。加強管理，增加光照，預防高溼低溫；選用抗病品種，並進行種子消毒（可用52℃水攪拌燙種30分鐘）。發病初期，可用10％敵託粉塵或7％葉黴淨粉塵噴粉，或用2％武夷黴素（BO－10）水劑150倍液噴霧。
防治番茄葉黴病，首先要注意保持通風透氣，及時摘除老化黃化的葉片，大棚種植要注意放風排溼，澆水後不要悶棚。當發現有病葉出現後，及時葉面噴灑300至400倍3%武夷菌素水溶液，或500至600倍0.5%小柴鹼水溶液等進行防治，每7至10天噴灑一次，連續噴灑2至3次，均勻噴溼所有的葉片。
為了有效預防該病的發生，首先，可選用抗病品種，在播種前對種子進行消毒處理，棚室可採用福爾馬林消毒或用硫磺粉閉棚燻蒸一夜，減少田間病菌數量。其次，要加強田間管理，使用充分腐熟的有機肥，培育健壯植株，使用膜下滴灌或暗灌，合理密植，控制田間溼度。最後，在發病初期及時用藥，可使用抑黴唑進行燻蒸，可用多抗黴素、甲基硫菌靈、嘧菌酯、氟菌·肟菌酯（露娜森）進行噴霧防治。
病，很難進行根除。在每次番茄澆水後，要及時加大通風量，降低田間的空氣溼度，可減輕病害的發生。要經常疏理比較密的枝葉，加強田間通風透光，同時要把得病的老枝病葉及時清理出去統一銷燬。在番茄種植比較多的地方，儘量聯防聯治，統一用藥，可加強防治的效果。
加強栽培管理。採用雙壟覆蓋地膜及膜下灌水的栽培方式，除可以增強土壤溼度外，還可明顯降低棚內空氣溼度，抑制番茄葉黴病的發生；對棚室番茄採用生態防治法，如控制棚內溫、溼度，適時通風，適當控制澆水，水後及時排溼，降低溫、溼度；露地番茄要注意田間的通風透光，不宜種植過密，並適當增施磷、鉀肥，提高植株的抗病能力；雨季及時排水，以降低田間溼度；及時整枝打杈，摘除病葉、老葉，增強通風；滴灌可降低棚室的相對溼度，勿大水漫灌。發病初期，摘除下部病葉片後及時噴藥保護，重點噴灑葉片背面。有效藥劑有多菌靈、異菌脲、武夷黴素、多·硫懸浮劑、甲基硫菌靈、百菌清、氟矽唑、苯醚甲環唑等。
加強棚室管理：及時通風，適當控制澆水，澆水後及時通風降溼；採用雙壟覆膜、膜下灌水的栽培方式，除可以增加土壤溼度外，還可以明顯降低溫室內空氣溼度，從而抑制番茄葉黴病的發生與再侵染，並且地膜覆蓋可有效地阻止土壤中病菌的傳播。根據溫室外天氣情況，通過合理放風，儘可能降低溫室內溼度和葉面結露時間，對病害有一定的控制效應。及時整枝打杈、植株下部的葉片儘可能的摘除，也可增加通風。實施配方施肥，避免氮肥過多，適當增加磷、鉀肥。
防治用樂譜道（殺菌丹+戊唑醇），愛可（烯肟菌胺+戊唑醇）或40%苯醚甲環唑，萬興（氟矽唑+惡唑菌酮），70%甲託或25%阿米西達懸浮劑2000倍液，或30%愛苗乳油4000倍液，或50%凱澤水分撒劑1500倍液，或60%防黴寶超微粉劑600倍等藥液。每7-10天一次，連續噴灑2—3次。若遇陰雪天氣，改用粉塵劑或煙霧劑。
