菌核病主要危害西葫蘆的莖蔓和果實。莖蔓染病後呈褐色水浸狀斑塊，逐漸長出白色菌絲和黑色菌核，病部以上的莖葉受其影響而萎蔫死。病果在花蒂部位呈現水浸狀腐爛，並長出白色菌絲和黑色菌核。
西葫蘆菌核病主要為害莖蔓、瓜條。莖蔓被害，初期出現水漬狀、淺褐色，後期莖蔓軟腐，長出白色菌絲。嚴重時病莖縱裂乾枯，莖內出現黑色菌核。瓜條受害，先發生於殘花部，然後引起瓜條發病，病瓜呈現水漬狀腐爛，長出白色菌絲，以後菌絲上長出菌核。菌核病是由真菌侵染引起的病害，常在塑料大棚內越冬，隨氣流傳播到植株上，從傷口、花器侵入體內，引起病害。
