豬肺炎支原體的流行傳播也具有一定獨特性和靈活性，豬場間相距3.2公里以內即可通過空氣進行氣膠傳播，豬場內豬群通過鼻液及直接接觸可以相互傳播，更讓人頭疼的是雖然不能在妊娠期間由母豬通過胎盤傳播給子豬，但在子豬哺乳前期極易由母豬傳染給子豬，同時奶水中的抗體不能清除子豬肺臟病原，難以阻止病原繁殖以及發病。現有資料表明該病的潛伏期可能在6周左右，即保育期間發病的豬隻最早可能在哺乳早期已經感染，因此對於肺炎支原體防控的重點為儘可能早做防疫，早產生抵抗力。
傳播途徑呼吸道是該病的主要傳播途徑，病原隨病豬咳嗽、氣喘、噴嚏排出，支原體侵入健康豬的呼吸道，粘附在喉管、氣管、支氣管纖毛上皮（數年或數月)，頂端增殖導致病變而感染。
豬肺炎支原體是經呼吸道的飛沫、病豬與健康豬之間鼻子與鼻子相互直接接觸傳播的。經母豬傳給仔豬使本病在豬群中持久存在，其嚴重程度常因管理水平、季節、通風條件、豬的密度有關。
