水旱輪作或2-3年輪作、清潔田園、防澇防積、藥物預防（定植後5天、15天、25-30天用咯菌腈或噁黴靈各防治一次）。甜瓜枯萎病屬土傳病害，需要綜合防治：1.土壤改良，可以用生物有機肥➕中微量元素➕土壤調理劑。2.培育無菌苗，3.移栽種苗用亮盾蘸根，4.發病前或初期，甲霜惡黴靈噴淋幼苗。
