芹菜苗期根腐病防治重在預防，結合園藝措施、生態調控等措施，並適時科學施用高效低毒低風險農藥防制。
加強水肥管理，預防病蟲害，科學管理。
（1）實行輪作：用無病菌土壤育苗或進行床土消毒。（2）科學用肥：注意增施生物有機肥和磷鉀肥，減少和防止單一使用氮肥。同時要加深耕層，增加土壤的透氣性。（3）藥劑防治：當病害剛發生時，可用50%多菌靈可溼性粉劑500倍液或70%敵克鬆可溼性粉劑800-1000倍液灌根，每10天灌，每10天灌一次，連灌兩次。
加強水肥管理和病蟲害防治工作。
芹菜苗期根腐病重在預防，生態調控，適時用高效低毒農藥防治。
合理輪訓作，加強田間管理。
1、種前深翻土壤；與非傘型花科和非茄科蔬菜實行輪作。2、合理澆水，並注意雨後排水；施用充分腐熟的農家肥；及時防治地下害蟲。3、及早拔除病株，清理病殘體，帶到田外集中銷燬。4、發病初期用藥，可選用98%惡黴靈可溼性粉2000倍、10%雙效靈水劑1000倍、50%多菌靈可溼性粉500倍或25%敵力脫乳油1000倍灌根，5~7天一次，連灌1～3次。
實行土壤輪作，能有效控制芹菜根病危害。
可用綠亨一號噴淋植株根部。
芹菜最怕重茬，以後種植可以選擇輪作種植，定值前期每畝使用哈茨木黴一公斤，枯草芽孢桿菌一公斤，豆粕有機肥一千多斤，功能肥五十公斤。
