番茄裂莖又稱番茄天窗莖，影響植株生長，植株易從開裂處折斷。露地、保護地番茄都有發生，主要發生在高溫期番茄上。多是在定植後20--30天發生在第3花穗附近。初時莖任一部分壞死變褐，7--14天后莖部異常，在節間出現縱溝凹陷，逐漸形成孔洞。輕微時，只形成縱溝或線形、Y字形縫隙。嚴重時，縱溝深凹成洞，並穿透莖形成中空，狀如天窗，症狀不僅出現在主枝，腋芽也有發生。裂莖一旦發生，發生部位的節間就顯著縮短，葉對生，花穗弱，往往著果不良。
病因主要是番茄定植成活後，由於高溫，控水過度，氮肥過多抑制了鈣、硼的吸收，致使幼嫩生長點受害或莖受傷所致。
防治措施是合理用肥，氮、磷、鉀肥配合施用。要特別注意避免氮肥過多。注意鈣、硼微量元素的施用。發現土壤乾燥應及時澆水，但避免灌大水。利用溫室進行番茄越夏栽培時，最好仍採用舊的塑料薄膜為覆蓋物遮光降溫，不要施用黑色的遮陽網。發生裂莖時，可用側枝代替主枝開花結果。
