1、藥劑預防：在未發病時，可噴布波爾多液，或在6月初至7月下旬對花椒樹用200到400倍液萎鏽靈進行噴霧保護。2、藥劑防治：對已發病的可噴百分之十五的粉鏽寧可溼性粉劑1000倍液，控制夏孢子堆產生。3、加強肥水管理，剷除雜草，合理修剪，晚秋及時清除枯枝落葉雜草並燒燬。4、栽培抗病品種，可以將抗病能力強的花椒品種混栽。
花椒鏽病的防治方法：①選用抗病品種，加強栽培管理，增強樹勢，提高抗病能力。②合理修剪是樹體通風透光良好。做好冬季清園，減少越冬病菌。在花椒園周圍禁栽柏樹。有資料現示松柏類是繡病，病菌的寄生主。③冬季清園可用波美5度石硫合劑或園清，清園專用劑等。④摘完花椒後可根據往年發病情況，及天氣情況。用戊唑醇，三唑酮，甲基託布津，等殺菌劑每15天交替使用，連噴2-3次。
太藥劑預防、藥劑防活、加強肥水管理，栽培抗病品種。
可以使用苯醚甲環唑進行防治。
要貫徹預防為主綜合防治植保方針。
