種子帶菌是主要侵染來源。土壤溫度低，墒情差，覆土厚，種子出苗慢，病菌侵染時間長，發病重。
黑穗病通過種子和土壤傳病，主要是土壤傳染，厚垣孢子在土記憶體活3年左右，在高粱種子露白尖到芽長1-1.5釐米時，侵染幼芽。散黑穗，堅黑穗病菌主要是以厚垣孢子在種子表面附著，帶病種子播種後，病菌與種子同時發芽，侵入寄主組織。病菌侵入後，菌絲蔓延到幼苗生長錐，以後隨著植株生長點向上生長而伸長，最後在穗部形成冬孢子。
穀子播種後的土壤溫溼狀況對侵染髮病影響很大。病原菌侵染幼苗的適宜土壤溫度為12—25℃，超過25℃則侵染受到抑制。買正品農資就上淘農網在較低的溫度下，穀子萌發與出苗緩慢，拉長了病原菌侵染的時間，發病就較重。土壤含水量在30％—50％適於病菌侵染，土壤乾旱或水分飽和都不利於病原菌侵染。種子帶菌率高，土壤溫度低，墒情差，覆土厚，幼芽滯留土壤中的時間延長，則發病加重。穀子品種間抗病性有明顯差異。
該病通過種子和土壤傳病，主要是土壤傳染，厚垣孢子在土記憶體活三年左右，在高粱種子露白尖到芽長1-1.5釐米時，侵染幼芽。
