主要為害果實和葉片，也可侵染莖部。葉片染病，初呈水浸狀褪色綠斑，後逐漸變為褐色。病斑近圓形，中間灰白色，上有輪生黑色小點粒，病斑擴大後呈不規則形，有同心輪紋，葉片易脫落。果實染病，初呈水漬狀黃褐色病斑，擴大後呈長圓形或不規則形，病斑凹陷，上有同心輪紋，邊緣紅褐色，中間灰褐色，輪生黑色點粒，潮溼時，病斑上產生紅色粘狀物，乾燥時呈膜狀，易破裂。
葉片染病，初為褪綠色水浸狀斑點，逐漸變成褐色，中間淡灰色，病斑上輪生小黑點。果柄受害，生褐色凹陷斑。果實被害，初現水浸狀黃褐色圓斑或不規則斑，斑面有隆起的同心輪紋，並生有許多黑色小點，潮溼時病斑表面溢位紅色粘稠物。果實上的病斑易幹縮呈膜狀，有的破裂。炭疽病是夏季辣椒特別是大田辣椒的主要病害，高溫多雨天氣或使用氮肥偏多，大水漫灌都容易引發炭疽病，炭疽病一旦發生，發病速度快，往往造成大面積的落葉和爛果現象，尤其是在辣椒生長中後期，辣椒炭疽病更容易發生。
