病原在病僵果、壞死組織內芽鱗片間越冬。條件適宜時通過氣流傳播，在蘋果開花期通過柱頭侵入危害。[1]蘋果花開以後，在果園內及樹體周圍環境中廣泛存在的各種真菌孢子，藉助氣流及昆蟲傳播到蘋果花柱等花蕊組織上，隨著花朵開放率的增長和開放時間的延長。花柱被侵染的比率迅速增高。病菌在花柱組織上定居後，逐漸通過枯死的花柱和開放的萼筒與心室之間的通道侵入果實心室。
病原菌能以菌絲形式寄生在寄主的芽、枝條、僵果、樹體、落葉，園中雜草上或以孢子的形式潛藏在寄主芽的鱗片上越冬。據研究，蘋果花芽各層鱗片都帶有鏈格孢菌，帶菌率由外層向內層逐層遞減，芽心花原始體不帶病菌。
從專對蘋果黴心病的發病規律作了細緻的闡述，有助於學認識預防。
