溫棚黃瓜的病蟲害很多，有蟲害和病害。溫棚黃瓜主要有疫病，炭疽病。溫棚黃瓜的病蟲害主要有:枯萎病、黃葉病、霜黴病、蚜蟲、白粉蝨、斑潛蠅等。要選用高效、低毒、低殘留的化學農藥，嚴禁超標使用農藥，種植黃瓜病蟲草害防治，要以預防為主，儘量少用或者不用化工合成農藥，推廣使用生物源農藥，生物防治，物理防治以及農業綜合防治。
