高溫高溼的氣候條件，再就是植株苗子定植時受傷了。
番茄莖基腐病發育適溫24℃，最高溫度40～42℃，最低溫度13～15℃。在陰雨天氣，或苗床或棚室溫度高，或施用未腐熟肥料，或土壤溼度大，或通風透光條件差，易發生莖基腐病。
茄病鐮孢以菌絲體和厚垣孢子隨病殘體在土壤中越冬，溼度大時病菌從傷口侵入，引起發病。後者以子囊殼或分生孢子器在病部或病落葉上越冬，條件適宜時產生孢子借風雨傳播進行初侵染和多次再侵染，致病害不斷擴充套件。雨日多、溼氣滯留易發病。
由真菌引起的病害，菌在土壤中越冬，腐生性強，可以在土中生存2-3年，大水漫灌且遇到地溫過高最易發病。
