在巨峰葡萄的生長過程中，尤其在多雨的南方，連續陰雨，溫度低溼度大，若管理不當，種植密度大，通風不良，極易得各種病蟲害。
巨峰葡萄常見病蟲害
1、主要病害
主要包括細菌性病害酸腐病，以及真菌性病害：霜黴病、灰黴病、白粉病、白腐病、黑痘病、褐斑病、炭疽病、潰瘍病和蔓枯病等。
防治藥物：可以使用鏈黴素，烯醯嗎啉，啶醯菌胺，多菌靈，苯醚甲環唑，丙森纈黴威等來防治病害。
2、主要蟲害
巨峰葡萄的常見蟲害分為三種：
（1）咀嚼式害蟲：鱗翅目，天蛾類，幼蟲危害葉片，鞘翅目，甲殼類，金龜子以成蟲為害，葉片和果實。
（2）刺吸式害蟲：同翅目，葉蟬類，粉蝨類，主要危害葉片，半翅目，盲蝽類，葉蟎類，主要危害，葉片，果實，果梗。
（3）銼吸式害蟲：纓翅目，薊馬，主要銼吸，幼果嫩葉新梢表皮汁液。
防治藥物：可以用吡蟲啉、噻蟲啉、氯氰菊酯、甲氰菊酯、滅多威、氯蟲苯甲醯胺及毒死蜱等來防治蟲害。
