藥用菊花根癌病主要發生在植株根頸處或側根及枝幹上，病部產生大小不等的腫瘤，初期腫瘤為灰褐色，表面光滑，質地不硬，後變為棕褐色，表皮粗糙或龜裂變硬，致地上部失綠或變黃，葉小且早落，病株生長緩慢或枯死。
防治方法
(1)嚴格檢疫，對懷疑有病的苗木用72％農用硫酸鏈黴素1500倍液加新高脂膜800倍液浸泡半小時或1％的96％硫酸銅加新高脂膜800倍液浸泡5分鐘，衝淨後定植。對於定植田及時用消毒藥劑加新高脂膜800倍液對土壤進行消毒處理。
(2)重病區實行2年以上輪作。並對定植土壤及時噴施消毒藥劑加新高脂膜800倍液進行消毒處理。
(3)加強田間管理，細心栽培，避免各種傷口，並在生長階段及時噴施新高脂膜800倍液形成保護膜，防止氣傳性病菌侵入。提高植株抗病能力，並在花蕾期噴施花朵壯蒂靈強壯花蕾，使花瓣肥大、花色豔麗、花香濃郁、花期延長。提高藥用菊花產量。
(4)藥劑防治，若發現重病株要及時拔除，同時根據植保要求對輕病株可用抗菌劑402對水300一400倍液加新高脂膜800倍液澆灌，或把瘤切掉用72％農用硫酸鏈黴素可溶性粉劑3000倍液塗抹，並配合噴施新高脂膜800倍液鞏固防治效果。
