串葉松香草和水花生（空心蓮子草）同屬多年生闊葉類植物，在串葉松香草生長期很難用除草劑有選擇地將田裡的水花生除掉。水花生具有發達的地下根莖，在串葉松香草收割後用除草劑進行土壤封閉也沒有什麼效果。
水花生也有其弱點。它喜光，不耐陰；植株匍匐生長。而串葉松香草直立生長，植株高大，莖葉生長繁茂。生產上可以通過促進串葉松香生長來抑制田間水花生的發生。田間有缺株的地方，應及時移苗補缺（可以分蔸移苗），不給水花生生長的空間。
及時用藥防除田埂邊的水花生，防止蔓延到牧草地危害。可以在水花生旺盛生長期，用10%草甘膦乳油50倍液（10%草甘膦乳油1000毫升加水50公斤），或農達200倍液定向噴霧，將雜草噴溼噴透。最好在串葉松香草收割當天噴藥，噴藥後立即將串葉松香草割掉，不讓草甘膦傳導到串葉松香草下部即可。對田內缺穴處的水花生也可以採用這種方法噴藥防治。對田間少量的水花生，還可以採用草甘膦藥液抹莖葉的方法加以防除。用藥處理後不要急於將水花生割除，讓藥物內吸傳導到水花生根莖部，這樣才能將水花生連根殺滅。草甘膦對人畜的面板、眼睛和上呼吸道有刺激作用，但無經口中毒報道。噴過草甘膦的串葉松香草可以在清洗或者晒乾後用來喂牲畜。
