基本的危害部位不同，前者葉片，後者稻穗。
區別在病斑大小、顏色和暈圈。
水稻稻瘟病是稜狀形褐色班點，水稻胡麻葉班病葉片上為不規則的褐色班點。
病斑不一樣，胡麻斑病主要是葉片，稻瘟病生長期均發病。後期發展為穂莖瘟或粒瘟。
胡麻葉斑病是不規則的小麻點，是田瘦引起的，稻瘟瘟是梭形病斑，與氣候、抗抗性等綜抗肥水管理種子的抗性等綜合因素有關。
水稻稻瘟病又稱熱病、火燒瘟、叩頭瘟。主要為害葉片、莖稈、穗部。因為害時期、部位不同分為苗瘟、節瘟、穗頸瘟、穀粒瘟。菌瘟：發生於三葉產，由種子帶菌所致。病菌基部灰墨，上部變褐，捲縮而死，溫度較大時病部產生大量灰黑色黴層，即病原菌孢子梗色暈圈，葉背有灰色黴層；水稻胡麻斑又稱水稻胡麻葉枯病。發病初期與葉瘟褐點型很難區分。病斑變大後呈橢圓形褐斑，周圍有黃色暈圈。大小如芝麻粒，但不形成梭形壞死線。穗頸和枝梗發病受害部暗褐色，造成穗枯。穀粒染病早期受害的穀粒灰黑色至全粒造成秕穀。後期受害病斑小，邊緣不明顯。病重穀粒質脆易碎。
稻瘟病具有傳染性各個生育時期都有發生胡麻斑病不傳染只在生育前期發生。
