該菌主要以冬孢子在土壤中越冬，有些則混入糞肥或粘附在種子表面越冬。土壤帶菌是最主要的初次侵染來源，種子帶菌則是病害遠距離傳播的主要途徑。冬孢子在土壤中能存活2～3年。冬孢子在玉米雌穗吐絲期開始成熟，且大量落到土壤中，部分則落到種子上(尤其是收穫期)。
玉米絲黑穗病菌的侵染迴圈：病原菌主要以冬孢子散落在土壤中、糞肥中或附著在種子表面進行越冬。冬孢子一般在土壤中存活2~3年，結塊冬孢子的存活時間會更長。冬孢子生活力較強，通過牲畜消化道，或漚肥而未經腐熟，都不能使其完全死亡。用冬孢子拌種，會極大的抑制發病率，但這卻是遠距離傳播的主要初侵染源。
玉米絲黑穗病可以由帶菌土壤傳播。
主要以冬孢子在土壤中越冬，有些則混入糞肥或粘附在種子表面越冬。
該菌主要以冬孢子在土壤中越冬，有些則混入糞肥或粘附在種子表面越冬。土壤帶菌是最主要的初次侵染來源，種子帶菌則是病害遠距離傳播的主要途徑。
