型別不同：磷肥以磷元素為主要養分，複合肥含有氮、磷、鉀中的兩種（或兩種以上）營養元素。
外觀不同：磷肥一般呈灰色粉末狀，複合肥多為顆粒狀。
作用不同：磷肥可以提高作物的產量，改善作物品質，增加作物的含糖量、含油量，複合肥能夠均勻釋放出養分，其肥效較穩且長，利於促進作物高產穩產。
用法不同：磷肥主要作為基肥與種肥，複合肥主要作為基肥與追肥。
一、型別不同
1、磷肥：全稱磷素肥料，以磷元素為主要養分，肥效的大小和快慢取決於土壤性質、放肥方法、作物種類、有效五氧化二磷的含量等。
2、複合肥：含有氮、磷、鉀中的兩種（或兩種以上）營養元素，優點為物理性狀好、養分含量高、副成分較少等。
二、外觀不同
1、磷肥：常用磷肥呈灰色粉狀（或顆粒狀），不溶於水，或部分溶於水。
2、複合肥：大多為顆粒狀，吸溼性小，不易結塊，便於儲存以及進行機械化施肥。
三、作用不同
1、磷肥：使用後可提高作物的產量，改善作物品質，加快穀類作物的分櫱速度，使籽粒更加飽滿；提高棉花、瓜類、果樹、茄果類蔬菜的結果率；增加甜菜、甘蔗、西瓜等作物的糖分，增加油菜籽的含油量。
2、複合肥：可充分發揮營養元素之間相互促進的作用，提高施肥效果。養分釋放均勻，肥效較穩且長，在作物生長期間能提供充足的營養，利於促進作物高產穩產。
四、用法不同
1、磷肥：主要作為基肥、種肥使用，根外追肥為輔。
2、複合肥：可作為基肥、追肥施用，施用量應視土壤肥力、作物種類等因素確定。
五、生產方式不同
1、磷肥：用磷酸、硫酸、硝酸或鹽酸分解磷礦，再將磷礦中的鈣以鈣鹽的形式分離或固定。
2、複合肥：用造粒工藝製取，比如轉鼓造粒、圓盤造粒、噴漿造粒、高塔造粒等。
