百日草白星病
症狀：葉上發病。初生暗褐色的小斑點，後成周邊暗褐色而中心灰白色、直徑2～4毫米的病斑。多在下部葉上發病，嚴重時葉卷枯。病斑表面有暗綠色黴狀物。
病原物CercosporazinniaeEllisetMartin為百日菊尾孢菌，屬真菌半知菌亞門。
傳染途徑以菌絲塊在種子或病殘體上越冬，也可在溫室栽培的病株上越冬，成為初侵染來源。病斑上的病菌也可通過風、雨、園藝操作來傳播。
百日草發病條件高溫高溼條件有利於病害發生。該病發病的適宜溫度為22～28℃，相對溼度85％以上。但高溫乾旱而夜間結露的情況下，也易發病。此外，缺肥、缺水，或大水漫灌，生長不良等都容易發病。
百日草防治方法
1、加強管理施足肥料，培育壯苗，防雨遮蔭，定植後適時澆水，防止大水漫灌。加強棚室通風，降低溼度。及時清除病殘體。
2、藥劑防治發病初期，及時摘除病葉，然後立即噴藥防治，可用1：0.5:200倍的波爾多液加0.1%硫磺粉,或65%代森鋅可溼性粉劑500倍,或75%百菌清可溼性粉劑500～800倍,或50%代森銨800～1000倍。
百日草黑斑病
百日草黑斑病又稱褐斑病。在全國各地均有發生。被侵染植株的葉子變褐乾枯，花瓣皺縮，影響觀賞。
症狀:葉、莖、花均可遭受此病危害。葉片上最初出現黑褐色小斑點，不久擴大為現規則形狀的大斑，直徑為2毫米～10毫米，紅褐色。隨著斑點的擴大和增多，整個葉片變褐乾枯。莖上發病從葉柄基部開始，縱向發展，成為黑褐色長條狀斑。花器受害症狀與葉片相似，不久花瓣皺縮乾枯。幼苗期，莖的基部受害時，形成深褐色中心下陷的潰瘍斑，病斑逐漸包圍莖部，使小苗呈立枯病症狀。
病原：為真菌百日草鏈格孢AlternariazinniaePa-pe。
侵染途徑：此病菌在病葉、病莖等殘體上越冬。帶病的也可能成為初次侵染源。病菌借風雨傳播，在百日草整個生長過程中都可侵染。特別是在高溫多溼的氣候條件下，發病最為嚴重。
防治方法：
1、選擇排良好的地段種植。栽植密度要適當。避免連作。種子播前要進行消毒處理（用50％多菌靈可溼性粉劑1000倍液侵種10分鐘）。秋後，病葉、病莖等集中銷燬，消滅來年的侵染源。從無病的健康母株上留種。
2、用50％代森鋅或代森錳鋅5000倍液或80％新萬生右溼粉劑600倍液噴霧。噴藥時，要特別注意葉背表面噴勻。
百日草花葉病（CMV）
全國各地均有發生，常常引起植株矮小、退化，觀賞性下降。
症狀：發病初期葉上片呈輕微的斑駁狀，以後成為深淺綠斑駁症。新葉上症狀更為明顯。
病原：引起百日草花葉病的病毒主要是黃瓜花葉病毒CMV。
傳染途徑：此病毒病可以由多種蚜蟲傳播，黃瓜花葉病毒的寄主範圍很廣，而且百日草生長季節又是蚜蟲活動期，蚜蟲與病害的發生有很大的相關性。
防治方法：滅蚜防病對百日草花葉病有一定的控制作用。另外，也要注意田間的衛生管理，根除病株，清除CMV的其它寄主，以減少侵染源。
