鹽鹼地區水稻育苗主要影響因素是鹽鹼為害，水稻立枯病和水稻爛秧、惡苗病等也相對較重。因此，搞好水稻育苗床土的調配，做好可能發生病害的預防工作，控制好溫度水分，對育苗之成敗尤為重要。
1.種子消毒：2006年春季由於在水稻浸種期間氣溫較低，加之某些品種惡苗病生理小種發生變化，因此有些常規浸種藥劑消毒效果較差，惡苗病發生比較普遍。針對這一情況，將惡苗淨加入滲透劑，調整助劑成分，使得惡苗淨防惡苗病效果達到99%以上；而且壯苗、生根、分櫱效果明顯。100克惡苗淨可浸種40公斤，常溫、室溫浸種都可以，一般浸5～7天就可催芽播種。
2.置床處理：鹽鹼地育苗，苗床地要選擇地勢較高且平坦，背風向陽，有水源地方做床。置床做成深溝高床，利於鹽鹼下滲、排洗。苗床地最好在頭一年上凍前深翻10釐米，加入適量的農家肥摟勻，蓋上稻草過冬。春季播種前將二銨或複合肥撒在床面上，施用量為每平方米30～50克，用耙子摟勻摟平，再用1000倍液硫酸水澆透，待床面水滲幹後在上面鋪隔離層。隔離層可以就地取材。如稻殼、廢編織袋、打孔地膜，或者用簡塑盤、拋秧盤、軟盤等。
3.營養土的配製：取鹽鹼比較輕的旱田土（沒施旱田除草劑的）、山皮土均可。用5毫米篩子過篩，加入30%有機肥或草碳土，再加入水稻育苗營養劑，如吉新藥肥酸混劑、育苗寶、壯苗精、三功能調理劑等。每袋可拌200～250公斤床土，育苗100～120盤。混拌均勻後的營養土即可平鋪在隔離層上或裝入盤中待播種用。
4.澆水播種：營養土裝盤鋪平後，用1000～1500倍硫酸水澆床面，之後播種。種量不能過大，每平方米250～300克種子為宜。
5.覆土、撒苗床除草劑：播完種後用拌有營養劑的床土蓋種，厚度1釐米為宜。再將苗床封閉除草劑一護秧，兌細土或細沙混拌均勻撒在床面上，即可蓋地膜和棚膜。護秧每袋50克，盤育苗可處理20平方米，拋秧盤可處理30平方米。
6.防立枯病：秧苗1.5個葉前澆立枯一次淨或枯必淨，每袋可處理40平方米苗床。秧苗2.5葉（離乳期）以後，如果秧苗徒長，根系不好，易得立枯病，在發病初期可用立枯一次淨或枯必淨兌水澆在發病處，3～5天即可發出新根長出新葉。這個期間如果床面返鹼嚴重，可澆一次2000～2500倍酸化水。
7.追肥：秧苗在2.5葉以後，根據秧苗顏色適當追施硫銨，每平方米施50～60克。
8.注意事項：
①播種前置床和床面必須澆透水，出苗後2葉前儘量少澆水，不幹不澆水。主要是控制上部徒長，促進根系發育。
②苗出齊後要及時抽掉地膜，棚內溫度不能超過30℃，晴天高溫要及時通風，避免高溫燒苗。
③2.5葉以後溫度控制在25℃以內，棚內要大通風，並及時澆水。
