抗病品種的夏孢子堆較小，周圍寄主組織枯死或失綠，近免疫的品種僅產生微小枯死斑。生育後期在葉片上還散生灰黑色圓形或長圓形皰斑，即冬孢子堆。葉鞘上也產生夏孢子堆和冬孢子堆。穀子鏽病以葉片受害為主，葉鞘也可發病。發病前期葉片不規則分佈著大量鐵鏽色、近圓形夏孢子堆，破裂後產生鏽粉狀夏孢子。後期散生灰黑色橢圓形小斑點，即冬孢子堆。重發時葉片乾枯，子粒秕瘦，甚至整株枯死。
