玉米缺磷嫩株敏感，植株矮化，葉尖、葉緣失綠呈紫紅色，後葉端枯死或變成暗紫褐色。幼苗期缺磷，莖和葉片暗綠帶紫紅色，從下部葉片開始，先是葉尖乾枯，沿葉緣向基部蔓延，進而呈暗褐色，以後逐漸向幼嫩葉片發展，根系發育不良，莖部衰弱，細長。孕穗至開花期缺磷，糖代謝與蛋白質合成受阻，雌穗減少，分化發育不良，花絲延遲抽出，授粉受阻，使受精不良，籽粒不充實，甚至空穗，並且會出現果穗捲曲，穗頂縊縮，會出現禿頂、缺粒與粒行不整齊現象。玉米缺磷在幼苗期和開花期都會出現不同的症狀，幼苗期缺磷玉米下部葉片開始出現暗綠色，並且從邊緣開始出現紫紅色；開花期缺磷禿頂、缺粒與粒行不整齊等症狀。
幼苗生長緩慢矮縮，根系發育差，葉片不舒展，莖和葉是暗綠而帶紫色，葉尖乾枯而成暗褐色。紫色是因玉米植株體內糖代謝受阻，葉中積累糖分較多，促進花色素苷的形成，使植株帶紫色。孕穗至開花期缺磷，糖代謝與蛋白質合成受阻，果穗分化發育不良。穗頂縊縮，甚至空穗，花絲也會延遲抽出，容易出現禿頂、缺粒與粒行不整齊、果穗彎曲等現象。
