防治重點是在小麥揚花期預防穗腐發生。在始花期噴灑，要在小麥齊穗揚花初期（揚花株率5～10%）用藥。藥劑防治應選擇滲透性、耐雨水沖刷性和持效性較好的農藥，每畝可選用25%氰烯菌酯懸浮劑100～200毫升，或40%戊唑·咪鮮胺水乳劑20～25毫升，對水30～45公斤細霧噴施。視天氣情況、品種特性和生育期早晚再隔7天左右噴第二次藥，注意交替輪換用藥。小麥赤黴病可防，不可治，防治關鍵是見花打藥。可用戊唑·咪鮮胺，戊唑·多菌靈，氰烯菌脂等藥劑防治。
