在棉花苗期管理上，要突出以追肥為補救手段，重視苗期追肥，施早施足苗肥，促進棉苗早生早發。為何要特別強調施用好棉花苗肥呢？原因有如下幾點：
一是棉花苗期是各生育期中含氮量最高的時期，氮素代謝最為活躍，此段的含氮量為3.3%以上，均高於其他的生育階段。
二是棉花苗期主根的生長速度，比地上部分幼莖增長快4-5倍。棉花第一片真葉開展之後，子葉中貯藏的養分基本用完，如果供肥不足，主根的延伸、側根的發育就會受到抑制。生產上要做到“壯苗先壯根，根深苗發橫。”
三是棉花苗期氣溫比較低，光照少，陰雨多，土壤溼度大，通透效能差，微生物活動受阻，棉田有機質分解和養分的釋放速度減慢，如果追肥遲而少，就不易被棉根吸收。
四是棉田地力後勁不足，土壤有機質含量呈下降趨勢，貯藏肥料及供肥能力弱化。
五是部分棉田耕作粗放，施用底肥數量不多，且施於土壤表層，雨後養分流失較多。
六是施用好苗期肥料，一可提高棉花的壯苗係數，二可增加真葉片數，三可增大真葉面積提高光合效率，四可加速生育程序。據農業科研部門研究，棉花出現3片真葉後，花芽就開始分化，施好苗肥可促進早生早發，使花芽提早分化，進而早現蕾、早開花、早結桃，早熟豐收。
在棉花苗期追肥技術上，應作以下改進：一是改輕視苗肥、不施苗肥為施早施足苗肥，採用營養缽育苗移栽的，移栽之前要在苗床上施好“送嫁肥”，移栽之後早追安苗肥。二是改施遲效肥為速效肥，提倡施用碳酸氫銨和尿素，定苗之後應追肥兩次，3-4片真葉時追第一次，每畝施碳酸氫銨8-9千克或尿素3-3.5千克。6-7片真葉時再追一次，每畝施碳酸氫銨15千克或尿素5千克。施用底肥較足的棉田，可酌情減施。三是改撒施、淺施為開溝或打壋深施，減少肥料流失。四是改幹施為施後澆水，以水調肥。據測定，棉花苗期施用氮肥未澆水的土壤速效氮的含量為17.5PPM，澆水后土壤速效氮含量為25PPM，上升了7.5PPM，效果顯著。
