玉米絲黑穗病發病原因很多，大致與使用感病品種及未腐熟的有機肥，連作，未處理的感病殘株，溫溼度等有關。
種植感病品種，連作、未處理的感病殘株。
主要種植感病品種，抽穗期遇雨、密度大易感染黑穗病。
雜交玉米絲黑穗病發病的主要原因是氣候。
玉米絲黑穗病是玉米生產上的主要病害之一。由於一些玉米品種的抗病性不強或致病菌的變異以及連續重茬栽培等原因,造成玉米絲黑穗病發生。
(一)感病品種的大量種植,是導致絲黑穗病嚴重發生的因素之一。(二)長期連作致使土壤含菌量迅速增加。(三)使用未腐熟的廄肥。(四)種子帶菌未經消毒、病株殘體未被妥善處理都會使土壤中菌量增加，導致該病的嚴重發生。(五)玉米播種至出苗期間的土壤溫、溼度與發病關係極為密切。
