主要侵染根部，致主根根尖變褐軟腐，根瘤墨綠色。病菌從根部維管束向上擴充套件至植株頂端。縱切根莖部，初期導管變淺褐色，後期變黑褐色。橫切病部，呈環狀排列的維管束變成深褐色，在溼潤條件下或用手捏壓時溢位渾濁的白色細菌膿液。病株上的果柄、莢果呈黑褐色溼腐狀。病株最初表現萎蔫，早上延遲開葉，午後提前合葉。通常是主莖頂梢第一、二片葉首先表現症狀，1~2天后，全株葉片從，上至下急劇凋萎，葉色暗淡，呈綠色，故稱“青枯”。
病菌有致病型和非致病型兩類。在TTC培養基上，致病型菌落較大，圓形或不整形，中心粉紅色，邊緣乳白色，無致病型菌落較小，圓形，深紅色。致病型青枯菌無鞭毛，菌體有明顯的粘質層；非致病型的菌體有1-4根極生鞭毛，菌體無明顯的粘質層。
