黑木耳栽培處在高溫高溼的季節，雜菌及病蟲害較多。有青黴、麴黴、木黴、根黴、菇蚊、馬陸、鼻涕蟲、蟎類等。木耳種植過程中常見的病蟲害不少，有青黴、麴黴、木黴、根黴、鏈孢黴引起的黴菌病。感覺啥都用藥，都不敢吃了。木耳常見病害主要是各種黴菌和流耳病。主要有黑木耳綠黴病、流耳、薊馬等，防治主要以預防為主，加強栽培環境消毒，溫溼度、通風、光照這些也要做好。蛞蝓、尺蠖、小蜘蛛、天牛、吉丁蟲等危害耳木的害蟲，青黴，麴黴。
