病株葉片褪綠程度通常較輕，表現為淺綠與深綠相間的花葉症狀，葉片稍皺縮。病葉上常出現1～3mm的黃斑，黃斑凹陷，單個或數個相連，葉脈變黃或褐色壞死。病毒可沿著部分維管束侵染部分葉片或半邊葉片。受感染葉片變小、扭曲、畸形，病株莖杆扭曲，明顯矮化。在嚴重情況下，病株葉片、莖或頂芽出現褐色壞死斑或條斑，最後導致全株死亡。芝麻得了花葉病後病株出現花葉、皺縮，莖稈扭曲、矮化，一般不結實或結蒴果小籽粒秕瘦，會導致減產或絕收。芝麻得了花葉病後會萎縮，長不高，籽殼小，嚴重的會枯死，直接導致減產或者絕收。
