養分不同：氮肥以氮為主要成分，磷肥以磷為主要成分。
外觀、溶解度不同：氮肥一般為白色晶體壯，水溶性較好，磷肥一般為灰色，不溶或部分溶於水。
作用不同：氮肥主要是促進作物莖葉生長，磷肥主要是促進花芽形成和分化，花粉發育，花粉管伸長。
施用方法不同：氮肥可用作基肥、追肥、種肥，磷肥一般用作基肥。
一、養分不同
1、氮肥指的是以氮元素為主要營養成分，具有氮標明量，施於土壤後可為植物提供氮素營養的單元肥料。
2、磷肥指的是以磷元素為主要營養成分，施於土壤後可為植物提供氮素營養的單元肥料。
二、產品外觀以及溶解度不同
1、目前市場上常見的氮肥一般呈白色晶體狀（石灰氮為黑色），並且水溶性較好。
2、常用磷肥一般為灰色，不溶於水或部分溶於水。其中主要成分為磷酸一鈣的磷肥相對易溶於水，主要成分為磷酸二鈣和磷酸三鈣的磷肥微溶於水。
三、對作物的作用不同
1、氮肥主要作用是促進植株枝條、秸稈、莖稈粗壯生長，增加葉片面積，提高葉片中的葉綠素含量。當氮肥施加不足時，作物生長速度緩慢，株高較矮，葉片薄、小，顏色發黃。
2、磷肥主要作用是促進作物花芽形成和分化，花粉發育以及花粉管伸長，從而提高作物的開花結果率。當磷肥施加不足時，作物花芽分化速度遲緩、花芽數量少、假花多，嚴重影響作物所結果實的數量以及產量。
四、施用方法不同
1、磷肥一般作基肥施用，後續發現作物出現缺磷症狀時，可葉面追施適量磷肥，讓磷元素通過葉片氣孔或角質層進入作物體內發揮作用（油菜、蔬菜作物，葉面噴施濃度為1%左右，水稻、麥類等禾本科作物，葉面噴施濃度為2-3%）。
2、氮肥可用作基肥、追肥、種肥，一般基肥佔比為30-60%，追肥佔比為40-70%，以深施為宜。
