冬季，不少農戶或種子站的工作人員往往由於種子的貯藏方法不當，給來年的農業生產造成極大的影響。現在，介紹幾種科學貯藏種子的方法。
種子內含有兩種水，一種是結合水（束縛水），它和種子裡面的膠體微粒緊密結合在一起，在通常較高氣溫下容易蒸發，在0℃以下低溫不會冰凍。另一種是自由水（遊離水），它和普通水一樣，到0℃時會冰凍，使種子受凍害。在氣溫較高幹燥的條件下，很容易從種子裡散發出來。通常種子入倉的安全貯藏水分標準，就是限制這種自由水的含量水平。
貯藏種子，無論是用麻袋、布袋或其他容器，都不宜直接放在地面上，以防種子吸溼返潮，降低種子的發芽率；最好用木板在地面上墊高50釐米左右；存放在房頂等露天的玉米種穗、花生種果等，頂部要用蘆蓆、草簾等蓋好，以防被雨、雪淋溼；如發現種子回潮，應及時採取措施晾晒，使自由水散發出去。
冬季氣候乾燥寒冷，但種子仍在不斷地進行呼吸，如果把種子和化肥、農藥混合貯藏在一起，由於化肥和農藥具有一定的揮發性，異味就會被吸附在種子表面。以後逐漸滲透到細胞裡面，就會損壞種胚、破壞種子的呼吸機能，嚴重影響種子的生活力，使種子的發芽率顯著降低。同樣，種子如較長時間被煙氣燻蒸，也會降低種子的發芽率和發芽勢。
進入深冬後，貯藏在室外的種子不要再轉入暖室裡，存放在室內的種子也不要再拿到室外。否則，突冷突熱也會影響種子的生機，降低種子的發芽率。在倉庫貯藏的種子，由於外界的溫度聚然下降，種堆表層往往會結露，結露現象同樣會引起種子發生質變。所以，倉庫應及時通風，並注意給種子堆內部通風、降溫、散溼。
種子貯藏期間，通常要以溫度、水分、蟲害、種質變化為主要內容進行經常性的檢查。一般種溫在0℃以下時，每月檢查1次；種溫在0℃以上時，每月檢查2次。在檢查時，可將種子堆分成上、中、下3層，每層設5個點，共15處取樣測定。對於靠近倉壁、屋角、近窗處和曾漏過雨的地方等部位以及在陰雪和陰雨等壞天氣裡，均應加強檢查。
