黑木耳栽培技術的不斷革新；使單產和產量大幅度的增長，但還滿足不了外貿出口和人民日益增長的需要。隨著人工栽培技術的推廣和發展，進一步推動了代用料栽培木耳新技術的試驗研究。目前主要以塑料袋栽培為主，其方法如下：
(1)生產流程
40天左右的栽培種（塑料袋）接種後經2個月左右→栽培袋（塑料袋）開洞→耳芽形成→成熟採收→第二次耳芽7～10天15～20天10天形成→成熟採收→第三次耳芽形成→採收15～20天10天15－20天
(2)選用優良菌種
栽培黑木耳的菌種，是由段木栽培黑木耳菌種中馴化篩選而來的，因此，並不是所有適於段木栽培菌種都可作為代料栽培的菌種。栽培種的菌齡在30～45天為適宜，這樣的栽培種生命力強，可以減少培養過程雜菌汙染，也能增強栽培時的抗黴菌能力。一般選擇菌絲體生長快，粗壯，接種後定植快；生產週期短、產量高、片大、肉厚、顏色深的作為菌種。
(3)栽培季節
在陝西及附近幾個省，利用自然溫度一年可以栽培兩次，春季一月上旬開始制原種，二月上旬制栽培種，三月中旬制栽培袋，四、五、六月出耳。秋季八月中旬制栽培袋，九、十、十一月出耳。
3．栽培方法
(1)配方
許多農林產品下腳料都可用來栽培黑木耳，下面介紹幾種培養基配方：
①木屑培養基配方
木屑（闊葉樹）78％
麩皮（或米糠）20％
石膏粉1％
白糖1％
水65％左右
②棉籽殼培養基配方
棉籽殼90％
麩皮（或米糠）8％
石膏粉1％
白糖1％
水65％左右
③玉米芯培養基配方
玉米芯（粉碎成黃豆大小的顆粒）70％～80%
鋸木屑（闊葉樹）10％～20％
麩皮（或米糠）8％
石膏粉1％
白糖1％
水65％左右
④稻草培養基配方
稻草（新鮮稻草粉碎或鍘成小段）75％
麩皮（或米糠）15％
鋸木屑（闊葉樹）8％
石膏粉1％
白糖1％
水65％左右
如果條件許可，在上述培養基中加入百分之二的黃豆粉更好。
(2)調料與裝袋
將以上培養料按比例稱好，拌勻，把糖溶解在水中注入培養料內，加水翻拌，使培養料含水量達65％左右。或加水至手握培養料，有水紋滲出而不下滴為度，然後將料堆積起來，悶30～60分鐘，使料吃透糖水，立即裝袋。裝袋的方法有三種，各有利弊，可根據情況選擇使用。
第一種方法，選用厚度在5微米左右，袋大小約17釐米X33釐米的底部為方形的塑料袋。如購買到平底袋（和食品袋一樣），在裝袋之前，先將袋底部兩個角向內塞至兩個角碰到即可，這樣裝入培養料後平穩，能直接放於培養架上。裝袋時，將已拌好的料裝入袋內，邊裝邊在平滑處用力振動，使培養料密實，並上下鬆緊一致，這時培養料的高度約為袋高的3／5，用幹紗布擦去袋上部的殘留培養料，加上塑料頸套（內徑34釐米、高3釐米）把塑料袋口向下翻，用橡皮筋紮緊，形狀像玻璃瓶口一樣，塞好棉塞。
第二種方法，選用直徑13釐米的簡狀聚丙烯塑料袋，剪截為35釐米的長度，一端用棉線紮緊，再用燭火或酒精燈火焰將薄膜燒熔化，使袋口密封。從開口的一端把培養料裝入袋內，邊裝邊在料堆上振動，或用手指壓實，待裝至距袋口5釐米處為止，然後把餘下塑料袋扭結在一起，用棉線紮緊，在燭火或酒精燈火焰下，將薄膜熔化密封。在光滑的桌面上用手將袋壓成扁形。再用直徑2釐米的打孔器，在袋的一面，每隔10釐米打一直徑2釐米、深1.5釐米的洞。用剪刀把準備好的藥用膠布，剪成3～4釐米見方的塊；貼在洞口上。為了便於接種時操作方便，膠布的其中一角捲成雙層。
第三種方法，選用直徑13釐米的商狀聚丙烯塑料袋，一端用線繩扎著，從另一端把培養料裝入袋內、用手把料壓實，待料裝至距袋口5釐米處為止，然後把餘下的塑料袋收攏起來，用線繩扎著、以後接種從兩頭接。應該注意：無論哪種裝袋方法，都必須做到，當天拌料，裝袋，當天滅菌。
4．滅菌與接種
裝好的栽培袋放在高壓滅菌鍋裡滅菌，在15公斤／釐米2的壓力下保持1.5～2小時，待壓力錶降到零時，將袋子趁熱取出，立即放在接種箱或接種室內。若用常壓滅菌灶滅菌，保持6～8小時，待袋溫下降到30℃時，或用高錳酸鉀和甲醛燻蒸30～40分鐘，進行接種箱或接種室空間消毒。接種時要注意，連續接種不要時間太長，以免箱內溫度過高（超過40℃）；接種量要多些，可以縮短菌絲長滿表面的時間，減少雜菌感染的機會。前已述及，黑木耳抵抗黴菌，特別是木黴的能力比較弱，因此，滅菌一定要徹底，接種時一定要按無菌操作進行，提高成品率。
5．菌絲培養
在菌絲培養的全過程中，要創造使菌絲體健壯生長，又能控制黑木耳子實體無規棒形成的條件。在諸條件中，溫度是最重要的因素。培養室的最適溫度為22℃～25℃，由於袋內培養料溫度往往高於室溫2℃～3℃，所以培養室的溫度不宜超過25℃。待別是在培養後期（即菌絲長到培養料高度約1/2以上），溫度超過25℃，在袋內會出現黃水，水色由談變深，並由稀變粘，這種粘液的產生，容易促使黴菌感染。培養室的相對溼度50％～70％，如果溼度太低培養料水分損失多，培養料乾燥，對菌絲生長不利，相對溼度超過70％，棉塞上會長雜菌。光線能誘導菌絲體扭結形成原基。為了控制培養菌絲階段不形成子實體原基，培養室應保持黑暗或極弱的光照強度。培養室內四周撒一些生石灰，使成鹼性環境，減少黴菌繁殖的機會。栽培袋放在培養染或堆積在地面上培養菌絲時，不宜多翻動。因為塑料袋體積不固定，用手捏的地方體積變化，把空氣擠出袋處，當手去掉時，其體積復原，就有少量的空氣入內。這樣就有可能進入雜菌孢子。另外，在手接觸袋壁的地方；增加了塑料袋與培養料的壓力，遇到較尖銳的培養料（鋸木屑、棉籽完）就會刺成肉眼看不見的小孔，雜菌孢子也會由此而進入，增加感染率。因此，在培養過程中儘量少動，在檢查雜菌時，一定要輕拿輕放，發現雜菌應及時取出，另放在溫度較低的地方；繼續觀察。若汙染程度比較輕，可用甲醛藥液注射到雜菌處，並用小塊膠布把針眼貼著，可控制雜菌繼續蔓延。
6．開洞
當黑木耳菌絲長滿提時，即可將菌袋從培養室移到栽培室，把棉塞、塑料頸套去掉，袋口用繩子紮好；或把膠布揭掉；準備兩盆5％的石灰水，先將袋子放在一個盆裡浸洗乾淨，取出。用刀片在袋子的四周，按兩洞之間5～6釐米的距離開長度l～1.5釐米，深及料內0.3釐米小口，也可先在菌袋的一側開洞。將已開洞的菌袋在另一盆石灰水中浸泡一下，使洞口處於鹼性環境，可有效地防治雜菌危害。
7．出耳期管理
開洞後的菌袋，可平放在栽培室的菌床架上，也可以懸掛在苗床架上或林下樹枝上，也可以放在鋪溼沙的地面上，隨即創造黑木耳形成子實體原基的條件。首先要增加栽培環境的相對溼度達90％～95％，室溫儘可能控制在20℃～25℃，良好的通風和較強的散射光照也是黑木耳原基形成必不可少的條件。開洞處菌絲體能得到較充足光線、空氣和溼度，有效地促進了此處子實體的形成。所以開洞栽培黑木耳，子實體都在開洞處形成或在塑料袋的破裂處形成。這就是所謂的"定向出耳"。
在適宜的溫度、溼度、通風和光照條件下，一股開洞7～12天，肉眼能看到洞口有許多小黑點產生；並逐漸長大，連成一朵耳芽（幼小子實體）。這時需要更多的水分，15℃～25℃的溫度，較強的散射光照和良好的通風。如果遇見連陰雨天氣，可把已形成耳芽的栽培袋掛在露天下，溫、溼、光、空氣都能充分滿足，耳芽發育更快。這時，如果在耳基部或幼小耳片上發現有綠黴菌和橘紅色鏈孢黴汙染，可將菌袋在水龍頭下，小心放水沖洗掉雜菌，但且勿把子實體沖掉。在適宜的環境條件下，耳芽形成後大約10～15天，耳片平展，子實體成熟，即可採收。
8．採收與加工
黑木耳成熟的標準是耳片充分展開，開始收邊、耳基變細，顏色由黑變褐時，即可採摘。要求勤採，細採，採大留小，不使流耳。成熟的耳子留在菌袋上不採，易遭病蟲害或流耳。採收時，用小刀靠袋壁削平。採收下的木耳要及時晒乾或烘乾。烘烤溫度不超過50℃，溫度太高，木耳會粘合成塊，影響質量，木耳幹後，及時包裝貯藏，防止黴變或蟲蛀。採收後的菌袋，停止直接噴水四五天，讓菌絲積累營養，經過10天左右；第二茬耳芽形成，重複上述管理，還可採收兩茬。
