辣椒爛果病害有灰黴病、臍腐病、軟腐病、日灼病、疫病、炭疽病。
灰黴病：選用40%嘧黴胺懸浮劑1200倍液防治。
臍腐病：結果期噴灑1%過磷酸鈣溶液。
軟腐病：選用綠得寶800倍液防治。
日灼病：盛果期噴施硝酸鈣、過磷酸鈣等葉面肥。
疫病：選用77%可殺得可溼性粉劑400倍液防治......
一、辣椒灰黴病
1、發病後及時摘除病果、病葉和側枝，然後帶出田外集中燒燬或深埋。
2、葉面噴灑25%咪鮮胺乳油2000倍液+嘉美金點1000倍液或50％異菌脲可溼性粉劑1000倍液+嘉美金點1000倍液進行防治，每隔7-10天噴灑1次，根據病情連續防治2-3次。
3、發病初期，選用40%嘧黴胺懸浮劑1200倍液或70%代森聯水分散粒劑600-800倍液、50%多黴清可溼性粉劑800倍液、50%多福疫可溼性粉劑1000倍液、68.75%惡唑菌酮·錳鋅水分散粒劑1000-1500倍液、40%嘧黴·百菌清可溼性粉劑800-1200倍液、64%氫銅·福美鋅可溼性粉劑600-800倍液、50%嘧菌環胺水分散粒劑800-1000倍液、25%嘧菌酯懸浮劑1500倍液、50%腐黴·百菌清可溼性粉劑600-800倍液、77%氫氧化銅可溼性粉劑800-1000倍液、33.5%喹啉銅懸浮劑800-1000倍液等噴霧防治，每隔7-10天噴灑一次，一共噴灑2-3次。
二、辣椒臍腐病
1、結果期之後，每隔7天左右噴灑一次0.1-0.3%氯化鈣或硝酸鈣水溶液，一共噴灑2-3次左右，或者是連續噴施綠芬威3號1000-1500倍液。
2、甜(辣)椒結果後30天內，為鈣元素吸收關鍵時期，此時噴灑1%過磷酸鈣溶液，或0.5%氯化鈣+5mg/kg萘乙酸溶液，或0.1%硝酸鈣容易以及愛多收6000倍液防治臍腐病。一般從初花期開始，隔10-15天噴灑一次，連續噴灑2-3次。
3、種植辣椒時，一般選擇株型偏小的辣椒品種，能夠避免旺盛的蒸騰作用。
4、土壤溼度不能發生劇烈變化，因此在降雨量較大的年份，平時應適當多澆水，防止下雨時土壤水分突然升高而引起臍腐病。
三、辣椒軟腐病
1、與非茄科作物及十字花科蔬菜類作物進行3年以上輪作。
2、加強田間管理，及時排出田間多餘積水；適時定植，合理密植；收穫後及時把病株、病果病殘體帶出田外深埋或燒燬。
3、下雨前後，選用12%松脂酸銅乳油1000-1500倍液、3%中生菌素可溼性粉劑1000-1200倍液、25%唯它靈薪可溼性粉劑4000倍液、新植黴素4000倍液、2%春雷黴素液劑1500倍液、72%農用鏈黴素可溼性粉劑4000倍液、78%波錳鋅可溼性粉劑500倍液、60%琥銅乙鋁鋅可溼粉劑500倍液、、30%王銅懸浮劑400-500倍液、50%琥膠肥酸銅可溼性粉劑400-500倍液噴、綠得寶800倍液、77%冠菌銅可溼性粉劑1000倍液、50%DT殺菌劑500倍液進行防治，每隔7-10天噴灑一次，連續噴灑2-3次。
四、辣椒日灼病
1、日灼病嚴重的地區，選用枝葉生長旺盛的辣椒品種，比如皇鼎一號、康大601等。
2、合理調控種植密度，讓植株相互遮蔭，減少果實在陽光下的暴露時間。如果有條件，可在田間搭設遮陽網，起到遮光降溫的作用。
3、合理澆水，促進土壤均衡供水。在結果盛期時，小水勤灌。
4、進入盛果期，及時噴施硝酸鈣、過磷酸鈣等葉面肥。
五、辣椒疫病
1、在播種前，使用10ml的2.5%適樂時懸浮種衣劑兌水150ml稀釋，然後與5kg辣椒種子混合均勻，包衣後播種。
2、在移栽定植前，使用25%甲霜靈可溼性粉劑500倍液或64%防毒礬可溼性粉劑500倍液，浸泡幼苗根部10-15分鐘左右，同時使用上述藥液對定植穴進行澆灌，每個穴內大約澆施50-60ml藥液。
3、發病初期時，選用50%甲霜銅可溼性粉劑600倍液或58%甲霜靈錳鋅可溼性粉劑600倍液、77%可殺得可溼性粉劑400倍液、72%克露可溼性粉劑500倍液、40%霜疫靈可溼性粉劑200倍液葉面噴灑進行防治。如果是大棚栽培，每畝地使用250-300g的45%百菌清煙霧劑進行防治，每隔7-10天用藥一次，連續用藥2-3次。
4、除開葉面噴灑以外，可選用50%甲霜銅可溼性粉劑600倍液或25%甲霜靈可溼性粉劑700倍液進行灌根，每株用藥250g，每隔5-7天灌根一次，連續灌根1-2次。
六、辣椒炭疽病
1、選擇優良辣椒品種進行栽培，比如湘研4號、湘研5號、湘研6號、早雜2號、中子粒等。
2、與麥類、玉米等禾本科作物實行2-3年輪作倒茬，同時儘量避免與瓜類、蔬菜連作。
3、發病初期時，選用75%百菌清可溼性粉劑600倍液或50%施保功可溼性粉劑1500-2500倍液、70%代森錳鋅可溼性粉劑500倍液、40%滅病威懸浮劑500倍液、50%混殺硫懸浮劑500倍液、50%多菌靈可溼性粉劑500倍液、57.6%冠菌清幹粒劑1000-1200倍液、68.75%易保水分散性粒劑1000倍液、70%甲基託布津可溼性粉劑800倍液、1：1：200波爾多液、80%炭疽福美800倍液進行防治，每隔7-10天用藥一次，連續用藥2-3次。
