隨著經濟的發展和人們生活節秦的加快，方便、乾淨、小包裝的鮮菇產品成為市場銷售的一個發展趨勢。現將其加工程式介紹如下：
鮮菇一經採收，須整齊排放在小型矮裝容器內，並儘快送往低溫車間進行整理。
容器的長、寬、高分別為４０釐米、８釐米、１６釐米，其形狀如週轉箱，底部實板，四周預設直徑２～３釐米的圓孔，底下四角均有內縮插接角塊，以便於碼高多層。鮮菇採收時順頭排放，不使頭尾相接，以免造成汙染。低溫車間內溫度為１～３攝氏度，可將普通恆溫冷庫改造後利用。鮮菇成箱搬入車間後分開擺放，不得再碼高多層，以便於菇體充分降溫，該環節對於氣溫高於１５攝氏度時採收的鮮菇尤為重要。整理的工具為薄片不鏽鋼刀或竹片刀以及小包裝封口、打箱裝置。
先用小刀將鮮菇基部削淨，去掉泥土、基料等雜物，鱗片多時應一併除去，一般不用水洗，否則會縮短產品貨架壽命。
待菇體內部降溫至３攝氏度以下時即可分裝。一般可用泡沫質地的材料製作成高５釐米左右的單盒，每盒約裝鮮菇１５０克。若禁銷塑料包裝，可定製紙質盒。雞腿菇一般適宜１６釐米×１０釐米×４釐米（長×寬×高）規格的包裝，姬松茸適宜１５釐米×１０釐米×６釐米規格的包裝，真姬菇、楊樹菇等適宜１６釐米×８釐米×４釐米規格的包裝。根據鮮菇形態及規格大小確定排放方式，然後封包保鮮膜。將小包裝盒再裝入泡沫保鮮箱內，每箱可裝３６盒，用透明膠帶封口即成。
另外，短期貯存和運輸時還可使用冰塊降溫保鮮或冷藏車運輸等方法，冷藏溫度控制在１～３攝氏度即可。
