水稻黑條矮縮病主要是由帶毒的飛蝨危害傳播的。水稻黑條矮縮病的發生原因有，水稻黑條矮縮病病毒的初侵染源和傳毒媒介有灰飛蝨、白背飛蝨，其中以灰飛蝨傳毒為主。因此，任何影響灰飛蝨越冬、遷移、生長繁殖的因素都直接影響此病的發生流行程度，其中以耕作制度和氣候條件最為重要。主要是白背飛蝨啃食有毒植株後帶毒，再啃食健康植株而傳播使之帶毒。水稻黑條矮縮病的發生是由帶毒白背飛蝨傳播的。
