1、剝殼催芽
（1）剝殼
採用鑷子和刀片，墊塊小木板，逐粒剝切種子果皮，要一邊剝一邊切，取出果皮內的完好菠菜種子。剝好的菠菜種子可催芽或直接播種。
（2）催芽
對發芽用的器皿、紗布、濾紙用沸騰放入熱開水進行。採用發芽皿，底層墊脫脂紗布，再鋪4層濾紙，把剝好的種子均勻排列在濾紙上，上面再蓋2層濾紙，澆適量水，貼上標籤，在20-25℃黑暗條件下發芽。
（3）檢查處理
剝殼發芽管理關鍵在於溫度和水分。試驗前3天溫度宜高，在25℃下催芽、20℃恆溫發芽較好。芽床水分以保持在手壓不出水為宜。發芽開始後要認真檢查記錄，發現黴爛應立即除掉，防止傳染。
2、低溫處理
用涼水浸種12-24小時，待果皮發黑時撈出，濾去多餘水分，放在4℃的冷庫或冰箱冷藏室裡處理24小時，然後在20-25℃條件下催芽；也可將浸種後的菠菜種子吊在水井的水上面催芽。3-5天出芽後即可播種。
3、過氧化氫溶液處理
過氧化氫浸種能有效除去菠菜種子表皮的膠質層，提高菠菜種子的發芽率，使菠菜播後出苗快且整齊。
方法是：將過氧化氫溶液按1:4比列兌水，經攪拌配製成20%-25%過氧化氫水溶液。將配製好的過氧化氫水溶液盛於容器中，倒入種子時應邊倒邊用木棒攪拌，使種子都能均勻吸水。當氣溫低於20℃時，浸種時間需100-120分鐘；氣溫高於20℃、低於30℃時，浸種時間60-90分鐘；氣溫高於30℃時，浸種時間30-50分鐘即可。
種子催芽浸種後將菠菜種子從過氧化氫水溶液中撈出，隨即用清水沖洗3-4次（邊衝邊濾水），濾水後盛於容器中用溼布巾覆蓋催芽。若種子成熟適度且飽滿，一般5-天就有85%以上的菠菜種子發芽，播種後2-3天即可出苗，比常規播種提前6-8天出苗。
用過氧化氫溶液浸種處理前，應把自留或購買的菠菜種子選擇晴天太陽下晒4-6小時，並剔除雜物和不飽滿的菠菜種子，用百菌清水溶液對已經浸種催芽的菠菜種子進行處理，浸種催芽處理後的菠菜種子應及時播種，大田（大棚）土壤要求溼潤，播種後覆土1-1.5釐米並加壓，使土壤與菠菜種子吻合，再用稻草簾覆蓋，待有10%-15%的幼苗出土時將草簾掀開。
